Se svými infrastrukturami jsme zapojeni do řady národních a mezinárodních výzkumných projektů, kde jsme již mnoho let vyhledávaným partnerem. Příkladem mohou být projekty TA ČR THÉTA a NCK, bezpečnostní výzkum (MV), projekty OP PIK (MPO), apod. Na mezinárodní úrovni je to především řada projektů z pilíře EURATOM v rámci programů Research and Innovation, kde v současné době spolupracujeme na řešení dvacítky projektů, z kterých dva rovněž koordinujeme.